Caenocryptus is een geslag van dieren uit het Paleozoïcum, voornamelijk bekend vanuit fossielen in Canada en de Verenigde Staten. Het leefde tijdens de late Siluur-tijd, ongeveer 415-410 miljoen jaar geleden. De naam Caenocryptus betekent “dankzij het kiezelsteen” in het Latijn. Deze dieren werden waarschijnlijk opgelost door eenvoudige fossielen die later waren afgezet als steentjes.
Caenocryptus was een zeedier en had waarschijnlijk een longsysteem zoals moderne zeezoogdieren. Het had ook een geheel nieuw type skelet dat de traditionele duidelijke delen van een skelet in één stuk heeft vastgelegd. De schaal van Caenocryptus is waarschijnlijk niet zo hard als die van huidige zeezoogdieren.